Le calme apparent de la forêt d'Othe ferait presque oublier la présence d'une faune très diversifiée, riche d'une soixantaine d'espèces d'insectes, de quatre-vingt-huit espèces d'oiseaux et de mammifères herbivores (chevreuil, cerf...) ou carnivores (renard, belette, chat sauvage...). Les zones humides et ripariennes de la forêt, comme ici au bord de l'Yonne, sont particulièrement fréquentées par cette faune et accueillent notamment des espèces menacées d'amphibiens comme la salamandre tachetée ou le triton alpestre.