L’église Santa Maria delle Grazie est connue pour abriter un des œuvres les plus célèbres du monde, la Cène de Leonardo da Vinci (Cenacolo Vinciano). La peinture a été réalisée entre 1494 et 1498 représente le dernier repas entre Jésus-Christ et ses apôtres. Il s’agit d’une énorme peinture murale de 4,60 m de hauteur et 8,80 m de largeur. Pour réaliser ce travail unique, Leonardo a fait une étude approfondie en créant un nombre infini de dessins préparatoires. En abandonnant la technique traditionnelle de la fresque, l'artiste a représenté une scène « a secco » sur le mur du réfectoire de l’ancien couvent dominicain. La technique utilisée et l’environnement ont contribué à la détérioration de la fresque qui a été rénovée de nombreuses fois. La rénovation la plus récente remonte à 1999, on y a employé plusieurs techniques scientifiques pour restaurer les couleurs d’origine, et, dans la mesure du possible, pour supprimer les marques de peinture appliquées par les tentatives précédentes de restauration de la fresque.